随着近年来国家对古文物保护，光学显微镜在文物研究上应用越来越广泛了，目前很多文物保护研究所的科学研究仍然是以光学显微镜为主，常规的实验室一般都配备了体视显微镜，金相显微镜，偏光显微镜，更进一步的实验室会陪着电子显微镜等。
在分析鉴定方面，光学显微镜主要以以下几方面的应用为主：
1，颜色分析，文物的色彩是鉴定工作的出发点，利用光学显微镜对古文物颜色的鉴定可以缩小文物研究的范围，只要选择好合适的放大倍数，合适的显微镜观察方式，很多晶体即可实现比较好的色彩还原。反映出真实的文物颜色。
2，对于有形状，实体文物来说，利用体视显微镜合适不过了。
3，对于文物的大小测量，主要是利用在显微镜上装载测微尺来实现，也可通过显微镜的数码摄像部分自带的图像处理软件来实现，更加。
4，对于出土文物的纸张，显微进行鉴定，观察方式可以分为两种。一种沿纤维的方向，一种是纤维的横截面，利用这样的方式来制样，可在显微镜上实现的观察。
5，通过显微镜对木材进行鉴定，这其中的制作过程可以分为染色，做片等几个步骤。通过观察木材的断面制样可以确定一些基本的因素。
