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尼康显微镜的物镜设计上，一般在标本聚焦清晰时，会在物镜前透镜元件到盖玻片表面的之间保留有一个较短的自由工作距离。如果所观察样本不是玻片类型，这段工作距离则为物镜前端到样品表面的线性距离。
物镜能显示齐焦距离和工作距离以及刻或印在物镜上的其他参数说明。一般来说，随着物镜放大倍率和数值孔径的增加，其工作距离会减小。一般制造商都是想尽可能去制造出长工作距离的空气镜，但又考虑这会限制影响去获取更高分辨率的高数值孔径参数，终也只能在这两者之间妥协而取一个折中的选择。
浸液物镜是在物镜前端和样本（如盖玻片）表面之间填充具有一定折射率的液体介质中工作的，因此其工作距离更受限制。如果工作距离太大，要维持物镜前端和样品之间浸没液的融合网络可能是一个问题，带来引入像差以及随之而来的成像质量退化影响。在工作距离非常短的物镜上加载弹簧组件，使其接触到样本盖玻片表面时，整个物镜前端组件将自动缩回。这种物镜上的弹簧组件通常被称为收缩安全塞，它能够给与样本以及物镜前端组件以充分的保护，防止意外损坏。
尽管在获取大数值孔径以及必要程度的光学像差上有困难，长工作距离物镜对于很多应用来说是*的，因此有些这类专门的物镜会根据不同的应用需求被设计出来。
对于一些体外需要透过厚玻璃壁实现标本检测的情况，长工作距离物镜特别有用。对于化学和冶金的显微镜来说，物镜前端必须做好保护措施以防止如热、腐蚀性蒸汽和挥发性化学物质等环境带来的危害。这些物镜的工作距离往往超过具有相同或稍高数值孔径物镜工作距离的2-3倍。
尼康显微镜的主要种类有生命科学仪器和工业仪器，前者主要包括正置生物显微镜、倒置生物显微镜、体视显微镜；后者则有正置金相显微镜、倒置金相显微镜、立体显微镜、偏光显微镜。
