尼康显微镜能把被观察的物体加以放大外，还能形成正的立体图象，具有立体感宛如我们直接用双眼观察物体一样。并且具有较长的工作距离、宽阔的视野，较好的成象质量。适用于工厂、研究部门及学校等单位的试验研究工作，更运用于仪表及细小精密零件的装配修理与生物解剖等工作。广泛应用于纺织制品、化工化学、塑料制品、电子制造、机械制造、医药制造、食品加工、印刷业、高等院校、考古研究等众多的领域。
尼康显微镜在细胞领域的观察方法中，样品不是*被照明，而是特定点由特殊光照明。散射光被降至低，样品细节非常清晰。随后，电脑控制拍摄多种照明的一系列照片，从而得到一个总体图片。这种巧妙的照明方式甚至允许调节景深，电脑控制能对多种景深进行拍照，然后将其结合为三维图像。该技术能在几秒内完成拍照，这样细胞活动就不会引起清晰度下降。
使用该显微镜，得到了活体多细胞生物的超分辨率3D图像。产生的多交点照明模式使研究者能排除焦外光干扰，从而使3D成像的样品厚度比普通成像更厚。研究人员每秒拍摄一次2D图像。
基于一系列显微图片，可得出微管运动的动态视频。在显微镜实验中，对动物细胞的观察，能够探索出一些奇特的生物学特性。
